八倍体草莓基因组结构与SNP标记数据集

数据集概述

本数据集围绕八倍体草莓(包括栽培草莓和野生种)的基因组结构、亚基因组变异及SNP标记展开,包含SNP基因分型数据、遗传图谱、探针信息及补充材料,为研究草莓染色体演化、亚基因组结构及遗传标记开发提供支持。

文件详解

  • 基因分型数据文件:
  • SNPcalls.850K_genotypes.txt:TXT格式,包含850K SNP芯片的基因分型数据,字段含probe_id(探针ID)、chrom(染色体)、pos(位置)及样本基因型信息
  • SNPcalls.50K_genotypes.txt:TXT格式,包含50K SNP芯片的基因分型数据
  • Affymetrix_FanaSNP_probe_info.txt:TXT格式,Affymetrix草莓SNP芯片的探针信息文件
  • 补充数据集文件:
  • Supplementary_Dataset_01.xlsx:Excel格式,补充数据集1
  • Supplementary_Dataset_02.xlsx:Excel格式,补充数据集2
  • Supplementary_Dataset_04.xlsx:Excel格式,补充数据集4
  • Supplementary_Dataset_03.zip:压缩文件,补充数据集3
  • genetic_maps.xlsx.zip:压缩文件,包含遗传图谱的Excel文件
  • 补充材料文件:
  • Supplemental_Materials.pdf:PDF格式,研究相关的补充材料文档

适用场景

  • 草莓分子遗传学研究:分析八倍体草莓亚基因组结构及染色体演化
  • 遗传标记开发:利用SNP芯片数据开发草莓分子标记辅助育种工具
  • 比较基因组学分析:探究八倍体草莓与二倍体祖先种的基因组共线性
  • 草莓育种应用:为草莓品种改良提供高密度遗传图谱及基因分型数据支持
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 756.42 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。