数据集概述
本数据集包含两组人类小BAM文件，分别用于RNA-seq和全外显子测序（WES）可视化教学练习。RNA-seq数据来自上皮间质转化细胞系的0天（未诱导）和7天（诱导后）样本，WES数据来自非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液组织样本，所有数据均从开放获取的SRA数据集处理而来。
文件详解
- RNA-EMT.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含人类RNA-seq BAM文件，对应上皮间质转化细胞系的Day 0（未诱导）和Day 7（诱导后）样本，序列比对至HG19基因组的18号染色体，基因CDH2为研究重点。
- WES-LUNG.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含人类WES BAM文件，来自非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液组织样本，序列比对至HG19基因组，保留了DUSP27、KRAS等基因的序列片段。
数据来源
Yang et al.（https://doi.org/10.1128/mcb.00019-16，SRA: PRJNA304419）、Ju et al.（https://doi.org/10.1101/gr.133645.111，SRA: ERP001071）
适用场景
- RNA-seq可视化教学：用于演示RNA-seq数据的BAM文件格式、序列比对结果及基因表达变化（如CDH2）的可视化分析。
- WES可视化教学：用于展示全外显子测序数据的BAM文件解读、肿瘤与正常组织的序列差异（如DUSP27、KRAS基因）可视化。
- 生物信息学入门培训：帮助初学者熟悉Illumina测序数据的BAM文件结构、比对工具（STAR、BWA）的应用及基因组可视化工具的操作。
- 测序数据处理练习：作为小样本数据集，支持RNA-seq和WES数据的比对结果验证、基因区域提取等基础生物信息学分析练习。
