数据集概述
本数据集包含斑马鱼unga(elu24)突变体描述性分析的原始数据与相关脚本,涵盖体型、生育力、基因表达、染色实验等多维度实验数据,支持对该突变体生物学特征的系统性研究。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共10个):
- 20250722-wt_vs_unga_size.csv:记录基因型(genotype)、性别(sex)、体型大小(size)数据
- unga-DEB_AcridineOrange_data.csv:吖啶橙染色实验数据
- unga_fertility_data.csv:生育力相关数据
- sperm_concentration_data.csv:精子浓度数据
- 20250727-wt-unga-testis_AO_staining.csv:睾丸吖啶橙染色数据(含切片、基因型、面积、计数等字段)
- unga_qPCR.csv:定量PCR实验数据
- unga_coexpressed_genes_list.csv:共表达基因列表
- 分析脚本(R格式,共7个):
- Figure2a-unga_SLAMseq_analysis.R:SLAMseq分析脚本
- Figure5a-unga_fertility_analysis.R:生育力分析脚本
- Figure2b-unga_daniocell_analysis.R:细胞分析脚本
- Figure4e-unga_DEB_treatment.R:DEB处理实验分析脚本
- 压缩文件(ZIP格式,共1个):
- wt-unga-DEB treatment-02-06-2025.zip:DEB处理实验相关压缩文件
适用场景
- 斑马鱼遗传学研究:分析unga突变体的表型特征与基因功能关联
- 生殖生物学研究:探究突变体生育力、精子质量的变化机制
- 毒理学研究:评估DEB处理对斑马鱼生理指标的影响
- 分子生物学分析:挖掘共表达基因网络与基因表达调控规律
- 实验数据复现:基于脚本重复或扩展突变体描述性分析实验