数据集概述
该数据集基于Pool-Seq技术和全基因组等位基因频率分析，包含23个金色线虫种群的遗传数据，覆盖9个国家的5种已知致病型，用于研究不同来源或致病型种群的遗传关系，验证了该方法在种群遗传学分析中的高效性与准确性。
文件详解
- 数据文件:
- UNEAK_PstI-MspI_23pop_0,8_0,01_SNP.txt、UNEAK_ApekI_23pop_0,8_0,01_SNP.txt等TXT格式文件: 包含SNP位点信息及等位基因频率数据，字段示例有Locus、Allele1、Allele2及各种群名称（如G_rosto_BEL_Ro1）
- Phylip_23pop_1_0,01_20.txt、Phylip_29pop_1_0,01_20.txt: 用于系统发育分析的Phylip格式文件
- Popoolation2_PstI-MspI_23pop_0,01_5_rc_cnt、Popoolation2_ApekI_23pop_0,01_5_rc_cnt: 种群遗传分析中间结果文件
- 脚本文件:
- scripts.txt: 可能包含数据分析所用脚本
- 补充文档与表格:
- Suppl Table1.docx: 补充表格文档
- Detail on samples.xlsx: 样本详情表格
- 补充图片:
- Suppl Fig1.png、Suppl Fig3.png、Suppl Fig4.png: 补充图表图片
适用场景
- 胞囊线虫种群遗传学研究: 分析不同致病型、不同地理来源种群的遗传关系
- 植物保护应用: 监测胞囊线虫种群动态，支持抗病品种培育与种植管理决策
- 分子生态学分析: 探究全球胞囊线虫种群的遗传分化与演化规律
- 生物信息学方法验证: 评估Pool-Seq技术在小型无脊椎动物种群遗传研究中的适用性
