数据集概述
本数据集为东部三线石龙子(Bassiana duperreyi)Y染色体标记识别研究的相关数据,通过计算机全基因组减法技术,从XY雄性和XX雌性基因组序列中筛选出Y染色体富集的序列,开发出7个可靠的Y染色体特异性标记,可用于识别该物种的基因型性别及其与表型性别的一致性。
文件详解
- README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:研究相关说明文档,包含实验背景、方法、结果等内容的文本说明
- 92_selected_contigs.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:FASTA格式的序列文件,包含筛选出的92个Y染色体富集的contig序列
- ksubtract_v2(1).cgi
- 文件格式:CGI
- 字段映射介绍:用于全基因组减法分析的脚本文件,支持识别Y染色体特异性序列的计算流程
- kassemble(1).cgi
- 文件格式:CGI
- 字段映射介绍:用于基因组序列组装的脚本文件,辅助生成Y染色体富集的contig序列
- 65M_minus_64F_contigs_large.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Excel表格文件,包含XY雄性与XX雌性基因组序列减法后得到的大型contig序列相关数据
适用场景
- 爬行动物性染色体进化研究: 分析东部三线石龙子Y染色体的序列特征、基因组成及进化规律
- 性别决定机制研究: 利用Y染色体特异性标记,探究低温诱导性别反转现象中基因型与表型性别的关系
- 分子性别鉴定: 应用开发的Y染色体标记,对野生种群进行基因型性别鉴定及性别比例分析
- 基因组分析方法优化: 基于计算机全基因组减法技术,优化其他生物Y/W染色体特异性序列的识别流程