Batrachochytrium_dendrobatidis_Based_蛙壶菌基因分型检测实验数据

数据集概述

本数据集为蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis)基因分型检测实验数据,包含基于Fluidigm Access Array平台的192个目标基因组区域的扩增测序结果,以及实验所用引物信息,可用于分析蛙壶菌的遗传多样性,助力研究其对两栖动物种群的影响。

文件详解

  • Bd_fluidigm_aligned_cleaned_consensus_byamplicon.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含经比对、清洗后的蛙壶菌基因分型检测扩增子共识序列数据,覆盖192个选定的基因组区域。
  • Bd_Fluidigm_Primer_Table.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:文档为实验所用引物信息表,记录了针对192个基因组区域设计的引物序列及相关参数。

数据来源

论文“Unlocking the story in the swab: A new genotyping assay for the amphibian chytrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis”

适用场景

  • 蛙壶菌遗传多样性研究:利用扩增子序列数据分析自然环境中蛙壶菌的基因变异与进化关系。
  • 两栖动物保护研究:结合野外采集的皮肤拭子检测结果,探究蛙壶菌对两栖动物种群的影响机制。
  • 基因检测技术优化:参考引物信息与检测方法,改进蛙壶菌非侵入式基因分型检测的效率与准确性。
  • 病原体监测应用:基于检测数据建立蛙壶菌种群动态监测模型,支持两栖动物疾病防控策略制定。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.26 MiB
最后更新 2026年1月4日
创建于 2026年1月4日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。