数据集概述
本数据集为蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis)基因分型检测实验数据,包含基于Fluidigm Access Array平台的192个目标基因组区域的扩增测序结果,以及实验所用引物信息,可用于分析蛙壶菌的遗传多样性,助力研究其对两栖动物种群的影响。
文件详解
- Bd_fluidigm_aligned_cleaned_consensus_byamplicon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含经比对、清洗后的蛙壶菌基因分型检测扩增子共识序列数据,覆盖192个选定的基因组区域。
- Bd_Fluidigm_Primer_Table.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:文档为实验所用引物信息表,记录了针对192个基因组区域设计的引物序列及相关参数。
数据来源
论文“Unlocking the story in the swab: A new genotyping assay for the amphibian chytrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis”
适用场景
- 蛙壶菌遗传多样性研究:利用扩增子序列数据分析自然环境中蛙壶菌的基因变异与进化关系。
- 两栖动物保护研究:结合野外采集的皮肤拭子检测结果,探究蛙壶菌对两栖动物种群的影响机制。
- 基因检测技术优化:参考引物信息与检测方法,改进蛙壶菌非侵入式基因分型检测的效率与准确性。
- 病原体监测应用:基于检测数据建立蛙壶菌种群动态监测模型,支持两栖动物疾病防控策略制定。