数据集概述
本数据集记录了巴西东南部基孔肯雅热(CHIKV)大爆发期间的媒介监测数据,包括蚊子样本中CHIKV RNA检测结果、病例统计以及系统发育分析等内容,为研究CHIKV传播规律及制定防控措施提供支持。
文件详解
数据集包含多种格式的文件,具体说明如下:
- 监测数据文件:
- CHIKV cases per epidemiological week in Sao Paulo state.txt:TXT格式,记录圣保罗州各流行病学周的CHIKV病例数
- CHIKV cases per epidemiological week in Southeastern states.txt:TXT格式,记录东南部各州各流行病学周的CHIKV病例数
- chikv_rp_2017-2024.txt:TXT格式,包含2017-2024年相关CHIKV数据
- GTR.txt:TXT格式,可能为基因进化分析相关参数文件
- 空间分布文件:
- N mosquitoes per collection point.html:HTML格式,展示各采集点蚊子数量
- CHIKV RNA detection in mosquitoes per collection point.html:HTML格式,展示各采集点蚊子样本中CHIKV RNA检测情况
- 系统发育分析文件:
- CHIKV_timetree.nexus:NEXUS格式,CHIKV时间树数据
- CHIKV_annotated_regions_tree.nexus:NEXUS格式,带注释区域的CHIKV系统发育树数据
- 补充材料文件:
- Supplementary tables S1-S9_NPJViruses.xlsx:XLSX格式,包含补充表S1-S9
- Supplementary_figures.pdf:PDF格式,包含补充图表
适用场景
- 流行病学研究:分析CHIKV在巴西东南部的传播趋势及爆发机制
- 媒介监测应用:评估蚊子媒介在CHIKV传播中的作用
- 系统发育分析:研究CHIKV的进化关系及引入事件
- 公共卫生防控:为制定CHIKV防控策略提供数据支持
- 空间分布研究:探究CHIKV传播的空间特征及影响因素