数据集概述
本数据集为评估腐肉蝇DNA宏条形码在生物多样性监测中的效能而产生，包含在巴拿马巴罗科罗拉多岛（BCI）开展的腐肉蝇采样及宏条形码分析相关数据。通过16S和12S引物进行测序，并对比BLAST与PROTAX工具的物种鉴定效果，检测到20种哺乳动物、4种鸟类和1种蜥蜴物种，为该技术在生物多样性监测中的应用提供数据支持。
文件详解
- 宏条形码序列文件
- 文件名称：mammal12S_OTU.fasta、mammal16S_OTU.fasta、mammal16S_refseqs.fa、mammal12S_refseqs.fa
- 文件格式：FASTA/FA
- 字段映射介绍：包含哺乳动物特异性（16S）和脊椎动物特异性（12S）的操作分类单元（OTU）序列及参考序列，用于物种鉴定和比对。
- 分析脚本文件
- 文件名称：protax_weighted_classify.bash、protax_weighted_train.bash、protax_train.bash、protax_classify.bash
- 文件格式：BASH
- 字段映射介绍：用于PROTAX工具的训练和分类分析脚本，支持物种鉴定流程的自动化执行。
- 物种列表文件
- 文件名称：panama_sp_list.txt、BCI_sp_list.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含巴拿马及BCI岛已知物种列表，用于物种鉴定结果的比对和验证。
- 其他辅助文件
- 文件名称：protaxscripts.zip、Mammalia_taxonomy
- 文件格式：ZIP/无扩展名
- 字段映射介绍：包含PROTAX分析所需的辅助脚本压缩包及哺乳动物分类学信息，支持物种分类的参考查询。
数据来源
论文“Carrion fly-derived DNA metabarcoding is an effective tool for mammal surveys: evidence from a known tropical mammal community”
适用场景
- 生物多样性监测技术评估: 分析腐肉蝇DNA宏条形码技术在热带哺乳动物群落调查中的效能，对比传统调查方法（如样线计数、相机陷阱）的物种检测能力。
- 物种鉴定工具优化: 比较BLAST与PROTAX工具在物种鉴定中的准确性，优化宏条形码数据分析流程。
- 热带生态系统研究: 基于BCI岛已知哺乳动物群落，探究腐肉蝇携带DNA的物种覆盖范围及生态代表性。
- 生物多样性调查方法创新: 评估腐肉蝇DNA宏条形码技术在大规模、长期生物多样性监测中的应用潜力，为生物多样性保护策略提供数据支持。
