数据集概述
本数据集围绕亚马逊林下草本植物Heliconia acuminata的基因扩散展开研究,通过贝叶斯遗传分析探究森林片段化与植物密度对其传粉、种子扩散及基因流动的影响。数据来自巴西森林片段化动态项目的连续森林与片段化样地,包含微卫星标记基因型数据、基因扩散模型代码及相关说明文档,可用于分析植物密度与基因扩散的关系。
文件详解
- 文件名称:
README_for_microsat_location_Hacuminata.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含项目背景、数据来源及文件内容概述。
- 文件名称:
genedispersalmodel_code_Cortes.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:基因扩散模型代码文档,记录用于贝叶斯遗传分析的模型实现方法与参数设置。
- 文件名称:
microsat_location_Hacuminata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:含3个工作表,其中“reproductives”表记录繁殖植株的位置、花和种子数量及基因型信息;“seedlings”表记录幼苗基因型数据;“year_reproduction”表记录繁殖年份相关信息。
数据来源
Brazil's Biological Dynamics of Forest Fragments Project
适用场景
- 植物基因扩散研究:分析Heliconia acuminata的花粉与种子扩散距离、外来繁殖体迁入率及亲本繁殖优势。
- 森林片段化生态效应评估:探究森林片段化与植物密度对基因流动的影响,验证保护遗传学理论假设。
- 分子生态学分析:利用微卫星标记数据研究种群遗传多样性、近交系数及空间遗传结构。
- 生物统计学模型应用:基于基因扩散模型代码,复现或扩展贝叶斯遗传分析方法。