数据集概述
本数据集围绕北极海洋Calanus属桡足类的物种与发育阶段识别展开,通过MALDI-TOF质谱蛋白质组指纹图谱技术,结合聚类与随机森林机器学习方法,实现物种(C1-C6期雌性)的精准区分及发育阶段特异性信号检测,为传统形态学难以完成的桡足类生物多样性评估提供数据支持。
文件详解
- 说明文档:
- README.txt:TXT格式,数据上传至Dryad项目的说明文件,介绍数据集背景与关联出版物信息
- 分析脚本与报告:
- Calanaus_script_species_level.html:HTML格式,物种水平分析的脚本与结果报告
- Calanaus_script_species-stage_classification.html:HTML格式,物种-发育阶段联合分类的脚本与结果报告
- Calanaus_script_stage_level.html:HTML格式,发育阶段水平分析的脚本与结果报告
- 参考数据表:
- ReferenceTable.csv:CSV格式,含物种(Species)、发育阶段(Stage)、站位(Station)、经纬度(Latitude/Longitude)、深度(Depth)、样本ID(id)、质谱信息(maldi_spec)、稀释度(dilution)、DNA信息(DNA)等字段
- 原始数据压缩包:
- Raw_Spectra.zip:ZIP格式,原始质谱数据压缩文件
适用场景
- 海洋生物学研究:分析北极Calanus属桡足类的物种组成与发育阶段结构
- 生物多样性评估:验证蛋白质组指纹图谱技术在桡足类生物多样性调查中的应用价值
- 气候变化影响研究:监测大西洋Calanus物种向极地迁移的动态变化
- 机器学习应用:探索随机森林等算法在生物样本分类(物种/发育阶段)中的效能