北极海洋桡足类Calanus属物种与发育阶段蛋白质组指纹图谱数据集

数据集概述

本数据集围绕北极海洋Calanus属桡足类的物种与发育阶段识别展开,通过MALDI-TOF质谱蛋白质组指纹图谱技术,结合聚类与随机森林机器学习方法,实现物种(C1-C6期雌性)的精准区分及发育阶段特异性信号检测,为传统形态学难以完成的桡足类生物多样性评估提供数据支持。

文件详解

  • 说明文档:
  • README.txt:TXT格式,数据上传至Dryad项目的说明文件,介绍数据集背景与关联出版物信息
  • 分析脚本与报告:
  • Calanaus_script_species_level.html:HTML格式,物种水平分析的脚本与结果报告
  • Calanaus_script_species-stage_classification.html:HTML格式,物种-发育阶段联合分类的脚本与结果报告
  • Calanaus_script_stage_level.html:HTML格式,发育阶段水平分析的脚本与结果报告
  • 参考数据表:
  • ReferenceTable.csv:CSV格式,含物种(Species)、发育阶段(Stage)、站位(Station)、经纬度(Latitude/Longitude)、深度(Depth)、样本ID(id)、质谱信息(maldi_spec)、稀释度(dilution)、DNA信息(DNA)等字段
  • 原始数据压缩包:
  • Raw_Spectra.zip:ZIP格式,原始质谱数据压缩文件

适用场景

  • 海洋生物学研究:分析北极Calanus属桡足类的物种组成与发育阶段结构
  • 生物多样性评估:验证蛋白质组指纹图谱技术在桡足类生物多样性调查中的应用价值
  • 气候变化影响研究:监测大西洋Calanus物种向极地迁移的动态变化
  • 机器学习应用:探索随机森林等算法在生物样本分类(物种/发育阶段)中的效能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 75.57 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。