北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案表

数据集概述

该数据集为表格式文件,呈现了通过PartitionFinder 2分析得到的北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案。内容涵盖基于nDNA、mtDNA及串联矩阵的三类分析,明确了不同基因区域对应的进化模型,为蝉类系统发育研究提供标准化的矩阵分区参考。

文件详解

  • 文件名称: table.html
  • 文件格式: HTML (.html)
  • 文件内容: 包含三类系统发育分析的矩阵分区方案:
  • 分析1(nDNA):4组分区,对应ARD1、EF1α等核基因区域及不同密码子位置的进化模型(如K80+Γ、GTR+Γ等)
  • 分析2(mtDNA):4组分区,对应16S、COI、COII等线粒体基因区域及不同密码子位置的进化模型(如HKY+I+Γ、GTR+I+Γ等)
  • 分析3(串联矩阵):6组分区,整合核基因与线粒体基因区域,明确各组合对应的进化模型(如F81+I、HKY+I+Γ等)

适用场景

  • 昆虫系统发育研究:用于北美蝉类(Tibicinoides属、Okanagana属)的分子进化分析
  • 进化生物学:为多基因联合分析提供标准化的矩阵分区及模型选择依据
  • 生物信息学方法验证:可作为PartitionFinder 2工具在蝉类基因组数据应用中的案例参考
  • 分类学研究:辅助解析北美大型蝉类辐射演化的遗传基础与分类关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
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