数据集概述
本数据集围绕北美东南部古水系连接变化对橙喉镖鲈（Ceasia亚属）物种形成、遗传多样性及地理分布的影响展开，整合祖先分布区重建与分化时间估算方法，检验Teays-Mahomet古水系演化假说。通过线粒体与核基因系统发育树及地理分布数据，利用DEC模型分析古水系连通性，揭示其作为冰期避难所间扩散通道的作用，包含5个相关分析文件。
文件详解
- 定年分析文件包
- 文件名称：dating_analyses_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含时间校准相关的分析数据，用于估算物种分化时间
- 拉格朗日分析文件包
- 文件名称：lagrange_analysis_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基于拉格朗日框架的生物地理分析数据，支持祖先分布区重建
- 标本基因库信息文件
- 文件名称：Specimen_Genbank.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录物种标本信息及基因库编号，包含species（物种）、clone_code（克隆代码）、ENC（基因编号）、GLYT（基因编号）等字段及对应基因库登录号
- 核基因系统发育解析文件
- 文件名称：spectabDNA_phyloParsed1.bay.unsafe
- 文件格式：unsafe
- 字段映射介绍：核基因系统发育分析的解析结果数据
- 线粒体基因系统发育解析文件
- 文件名称：spectabmtDNA_2phyloParsed71911.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：线粒体基因系统发育分析的解析结果元数据
数据来源
论文“Explicit tests of paleodrainage connections of southeastern North America and the historical biogeography of Orangethroat Darters (Percidae: Etheostoma: Ceasia)”
适用场景
- 淡水鱼类生物地理学研究：分析古水系变化对橙喉镖鲈物种形成与分布的影响
- 冰期避难所验证：探究橙喉镖鲈冰期避难所的数量与位置
- 古水系演化假说检验：验证Teays-Mahomet古水系的演化及连通性假说
- 生物多样性保护：为北美东南部淡水鱼类遗传多样性保护提供历史生物地理依据
- 系统发育与生物地理模型应用：支持DEC等生物地理模型在淡水生物研究中的实践验证
