BIGG_COBRAPY_Based通用代谢模型JSON格式及转换代码

数据集概述

本数据集提供BIGG通用代谢模型的COBRAPY JSON格式文件，同时包含用于模型转换的Jupyter Notebook文件。数据支持代谢网络模型的解析与应用，共包含两个文件，无目录层级结构。

文件详解

• 模型文件
• 文件名称：universal_model_cobrapy.json
• 文件格式：JSON
• 字段映射介绍：BIGG通用代谢模型的COBRAPY格式文件，包含代谢网络模型的核心结构与参数信息。
• 转换代码文件
• 文件名称：universal_model.ipynb
• 文件格式：IPYNB
• 字段映射介绍：用于将BIGG模型转换为COBRAPY JSON格式的Jupyter Notebook代码文件，记录模型转换的实现过程。

适用场景

• 代谢网络建模研究：用于构建和解析通用代谢网络模型，支持代谢通路分析与模拟。
• 计算生物学分析：为COBRAPY框架下的代谢模型应用提供基础数据，支持通量平衡分析等计算任务。
• 模型转换方法参考：通过转换代码文件学习BIGG模型到COBRAPY格式的转换实现。
• 生物信息学教学：作为代谢模型数据格式与转换的教学案例，辅助相关技术学习。