数据集概述
本数据集包含Bignon et al.,2023研究中生成的小鼠肾脏、血浆代谢组学数据，含原始数据与处理后数据。肾脏数据经缺失值过滤、归一化等预处理，血浆数据经缺失值过滤与log2转换，可用于研究肾小管生物钟对肾脏及系统代谢的调控机制。
文件详解
- 小鼠肾脏原始数据文件
- 文件名称：YB2022_kidney_rawdata_metabolon.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Metabolon平台生成的小鼠肾脏代谢组原始质谱数据
- 小鼠肾脏处理后数据文件
- 文件名称：YB2022_kidney_procdata_filtered_880features_scaled_imputed_glog2_annot.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：含COMP_ID、CHEMICAL_ID、BIOCHEMICAL等代谢物注释字段，及ZT0_C1、ZT0_KO1等对照组与敲除组样本的处理后代谢数据
- 小鼠血浆原始数据文件
- 文件名称：YB2022_plasma_rawdata_biocrates.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Biocrates平台生成的小鼠血浆代谢组原始质谱数据
- 小鼠血浆处理后数据文件
- 文件名称：YB2022_plasma_procdata_nomissing_333features_log2_annot.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：含代谢物注释字段及对照组与敲除组样本的处理后血浆代谢数据
数据来源
论文“Multiomics reveals multilevel control of renal and systemic metabolism by the renal tubular circadian clock”（Bignon et al.,2023）
适用场景
- 肾脏代谢调控研究：分析肾小管生物钟对肾脏代谢通路的影响
- 系统代谢关联分析：探究肾脏代谢与血浆代谢的关联机制
- 代谢组学数据预处理方法验证：对比不同预处理流程对代谢数据的影响
- 生物钟与代谢交互机制研究：结合多组学数据解析生物钟对代谢的调控网络
