数据集概述
本数据集为昆士兰东南部淡水物种比较系统地理学研究的综合数据,整合33种淡水物种(23种鱼类、10种甲壳类)的1814条序列数据,覆盖8个流域。通过单物种分析(单倍型网络、遗传距离等)和多物种方法(分层ABC),探究流域对遗传结构的影响、流域间生物地理边界及深层谱系分化的驱动因素,数据包含3个压缩文件。
文件详解
- TCS输入文件包
- 文件名称:TCS input files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于构建单倍型网络的TCS分析输入数据,支持单物种遗传结构解析
- MTML-msbayes输入文件包
- 文件名称:MTML-msbayes input files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含多物种溯祖分析的MTML-msbayes输入数据,用于多物种比较框架下的谱系分化时间推断
- Arlequin输入文件包
- 文件名称:Arlequin input files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含群体遗传学分析工具Arlequin的输入数据,支持遗传距离、ΦST等单物种遗传分化指标计算
数据来源
论文“Contrasting insights provided by single and multispecies data in a regional comparative phylogeographic study”
适用场景
- 淡水物种遗传结构分析: 利用TCS输入数据构建单倍型网络,解析33种淡水生物的种群遗传分化模式
- 流域生物地理边界探究: 通过多物种数据对比,识别昆士兰东南部流域间的关键生物地理分界线
- 谱系分化时间推断: 基于MTML-msbayes输入数据,推断区域内深层遗传谱系的分化时间与驱动事件
- 比较系统地理学方法验证: 对比单物种与多物种分析结果,评估不同方法在区域生物地理研究中的应用价值