比利时LUCAS生物点土壤生物多样性采样与eDNA宏条形码协议比较数据集

数据集概述

该数据集围绕比利时LUCAS生物点土壤生物多样性监测展开,对比2018年LUCAS协议与新开发的国家方法,测试不同采样深度、样本量、子样本数量及引物组合对土壤生物多样性检测的影响。数据集包含交互式Krona分类图表及样本元数据,用于可视化不同采样方案和引物下的类群多样性与相对丰度,为土壤生物多样性监测方法优化提供支持。

文件详解

  • 交互式分类图表文件(HTML格式):
  • ejp_soil_annelida_olig01_27913.html:环节动物(Annelida)分类图表,使用Olig01引物,数据稀疏化至两万七千九百一十三条读数
  • ejp_soil_collembola_coll01_31655.html:弹尾目(Collembola)分类图表,使用Coll01引物,数据稀疏化至三万一千六百五十五条读数
  • ejp_soil_arthropoda_inse01.html:节肢动物(Arthropoda)分类图表,使用Inse01引物
  • ejp_soil_fungi_its9mun_its4ngsuni_1856.html:真菌(Fungi)分类图表,使用ITS9mun/ITS4ngsUni引物,数据稀疏化至一千八百五十六条读数
  • ejp_soil_protists_18s_19728.html:原生生物(Protists)分类图表,使用18S引物,数据稀疏化至一万九千七百二十八条读数
  • ejp_soil_archaea_ssu1arf_ssu1000arr_19632.html:古菌(Archaea)分类图表,使用SSU1ArF/SSU1000ArR引物,数据稀疏化至一万九千六百三十二条读数
  • ejp_soil_annelida_18s.html:环节动物分类图表,使用18S引物
  • ejp_soil_collembola_18s.html:弹尾目分类图表,使用18S引物
  • ejp_soil_arthropoda_18s.html:节肢动物分类图表,使用18S引物
  • 元数据文件:
  • ejp_soil_metadata.csv(CSV格式):包含样本名称、采样地点、协议类型、采样深度、土地利用类型、EUNIS栖息地分类、LUCAS-ID等字段

适用场景

  • 土壤生物多样性监测方法优化研究
  • 不同引物组合对土壤生物类群检测效果的比较分析
  • 土壤垂直分层(0-10cm与10-30cm)对生物多样性分布的影响研究
  • 土壤生物多样性可视化与类群相对丰度分析
  • 欧洲土壤生物多样性监测协议标准化参考
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.32 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
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