数据集概述
该数据集围绕比利时LUCAS生物点土壤生物多样性监测展开,对比2018年LUCAS协议与新开发的国家方法,测试不同采样深度、样本量、子样本数量及引物组合对土壤生物多样性检测的影响。数据集包含交互式Krona分类图表及样本元数据,用于可视化不同采样方案和引物下的类群多样性与相对丰度,为土壤生物多样性监测方法优化提供支持。
文件详解
- 交互式分类图表文件(HTML格式):
- ejp_soil_annelida_olig01_27913.html:环节动物(Annelida)分类图表,使用Olig01引物,数据稀疏化至两万七千九百一十三条读数
- ejp_soil_collembola_coll01_31655.html:弹尾目(Collembola)分类图表,使用Coll01引物,数据稀疏化至三万一千六百五十五条读数
- ejp_soil_arthropoda_inse01.html:节肢动物(Arthropoda)分类图表,使用Inse01引物
- ejp_soil_fungi_its9mun_its4ngsuni_1856.html:真菌(Fungi)分类图表,使用ITS9mun/ITS4ngsUni引物,数据稀疏化至一千八百五十六条读数
- ejp_soil_protists_18s_19728.html:原生生物(Protists)分类图表,使用18S引物,数据稀疏化至一万九千七百二十八条读数
- ejp_soil_archaea_ssu1arf_ssu1000arr_19632.html:古菌(Archaea)分类图表,使用SSU1ArF/SSU1000ArR引物,数据稀疏化至一万九千六百三十二条读数
- ejp_soil_annelida_18s.html:环节动物分类图表,使用18S引物
- ejp_soil_collembola_18s.html:弹尾目分类图表,使用18S引物
- ejp_soil_arthropoda_18s.html:节肢动物分类图表,使用18S引物
- 元数据文件:
- ejp_soil_metadata.csv(CSV格式):包含样本名称、采样地点、协议类型、采样深度、土地利用类型、EUNIS栖息地分类、LUCAS-ID等字段
适用场景
- 土壤生物多样性监测方法优化研究
- 不同引物组合对土壤生物类群检测效果的比较分析
- 土壤垂直分层(0-10cm与10-30cm)对生物多样性分布的影响研究
- 土壤生物多样性可视化与类群相对丰度分析
- 欧洲土壤生物多样性监测协议标准化参考