数据集概述
本数据集是用于测试BinaryClust2批量归一化功能的CyTOF测试数据，原始数据来自Trussart等人2020年的研究。包含6个文件，涵盖FCS格式的原始数据文件和XLSX格式的元数据、面板信息文件，支持BinaryClust2工具的功能验证与测试。
文件详解
- FCS数据文件（共4个）
- 文件名称：Run3_A2.fcs、Run3_A1.fcs、A2.fcs、A1.fcs
- 文件格式：FCS
- 字段映射介绍：CyTOF原始数据文件，包含细胞群体的金属标记检测信号数据，用于BinaryClust2的批量归一化功能测试
- XLSX辅助文件（共2个）
- 文件名称：Metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集的元数据信息，可能包含样本来源、实验条件等描述性数据
- 文件名称：Panel.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：CyTOF实验的面板信息，可能包含抗体标记的靶点、金属同位素等实验设计数据
数据来源
Trussart et al. (Marie Trussart, Charis E Teh, Tania Tan, Lawrence Leong, Daniel HD Gray, Terence P Speed (2020) Removing unwanted variation with CytofRUV to integrate multiple CyTOF datasets eLife 9:e59630 https://doi.org/10.7554/eLife.59630)
适用场景
- 生物信息学工具测试: 用于验证BinaryClust2工具的批量归一化功能准确性与稳定性
- CyTOF数据处理方法研究: 探索CyTOF数据集的批量效应去除与归一化策略
- 单细胞数据分析流程验证: 构建CyTOF数据分析流程时的测试用例
- 生物信息学算法开发: 为CyTOF相关算法的开发提供标准测试数据集
