病毒适应性进化图谱代码

数据集概述

本数据集为计算随时间测序病毒适应性进化速率的代码集合，包含两个Jupyter Notebook文件，分别采用不同方法（动态更新外群与固定外群）计算进化速率，为病毒适应性进化分析提供技术工具支持。

文件详解

• 文件名称: rate_of_adaptation.ipynb
• 文件格式: Jupyter Notebook (.ipynb)
• 功能描述: 采用随时间更新外群的方法计算病毒适应性进化速率
• 文件名称: rate_of_adaptation_bhatt.ipynb
• 文件格式: Jupyter Notebook (.ipynb)
• 功能描述: 采用固定外群的方法计算病毒适应性进化速率

适用场景

• 病毒进化研究: 分析不同病毒随时间的适应性进化速率变化
• 分子进化分析: 比较动态外群与固定外群两种方法在进化速率计算中的差异
• 传染病防控研究: 为病毒变异趋势预测提供数据计算工具支持
• 生物信息学应用: 作为病毒进化分析的代码模板或参考实现