数据集概述
本数据集为病原体先天免疫记忆进化实验相关研究的支撑数据，包含实验中死亡率比例、孢子负载、基因表达、基因组变异等多维度数据，以及用于分析和复现研究结果的脚本文件，可辅助理解病原体在先天免疫记忆压力下的毒力变异规律。
文件详解
- 数据文件：
- Proportion_mortality.csv：CSV格式，含各重复组的死亡率比例数据，用于绘制毒力相关图表
- Selection_mortality.csv：CSV格式，含宿主存活（0）/死亡（1）状态数据，用于统计分析
- Spore_load.xlsx：XLSX格式，含孢子负载数据，用于绘制孢子负载相关图表
- Spore_load.csv：CSV格式，含孢子负载数据，用于统计分析
- Sporeload_mortality_spores_fitness.csv：CSV格式，整合死亡率比例、平均孢子生长及适合度数据，用于相关分析和图表绘制
- average_proportion_priming_sensitivity_fitness.csv：CSV格式，含启动敏感性及与适合度相关性数据，用于分析和图表绘制
- 2023-08Btt-cry-qPCR-results.csv：CSV格式，含Cry基因表达qPCR结果数据，用于基因表达分析和图表绘制
- Final_variants.xlsx：XLSX格式，含基因组变异数据，用于绘制热图
- plasmids.xlsx：XLSX格式，含质粒相关数据，用于分析和图表绘制
- plasmids_cry.xlsx：XLSX格式，含Cry基因表达与质粒相关性数据，用于相关分析
- Phage_log2diff.xlsx：XLSX格式，含噬菌体覆盖度log2差异数据，用于分析和图表绘制
- Pearson global.csv：CSV格式，整合孢子生长、毒力、基因表达等多维度数据，用于相关性矩阵分析
- Pearson's new data set.csv：CSV格式，整合启动敏感性、适合度、基因表达等数据，用于相关性矩阵分析
- 脚本文件：
- Main_FIN.R：R格式，用于贝叶斯分析的主脚本
- analysis.R：R格式，用于贝叶斯分析的辅助脚本
- 其他文件：
- Markdown_file.html：HTML格式，含研究相关的R Markdown分析脚本，可复现研究分析过程
适用场景
- 病原体进化研究：分析先天免疫记忆压力下病原体毒力变异规律
- 微生物适应性研究：探究病原体在免疫压力下的适合度变化及相关机制
- 分子生物学研究：分析病原体基因表达、基因组变异与毒力的关联
- 生物统计学应用：利用多维度实验数据进行统计模型构建与验证
