数据集概述
本数据集围绕濒危淡水海豹(芬兰塞马环斑海豹)的宿主特异性虱子(Echinophthirius horridus)展开,通过种群基因组方法分析其近交水平、空间种群结构及与宿主的关联特征,为濒危物种寄生虫的保护研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多种类型文件,具体说明如下:
- 文档与文本文件(.txt格式,共12个):
- README_seallice.txt:数据集说明文档,包含研究背景、作者信息等。
- Seal_lice_IBD_.txt系列文件(如Seal_lice_IBD_one_random_individual_per_infrapopulation_D7.txt):记录基因分型数据,用于近交系数(IBD)分析。
- 图像文件(.jpg格式,共46个):
- Echor.PMax.jpeg.jpg系列文件(如Echor24.PMax.jpeg.jpg):可能为虱子样本的形态学或基因组可视化图像。
- 种群遗传学分析文件:
- Seal_lice_Arlequin_file_for_hierarchical_AMOVA.arp(.arp格式):用于Arlequin软件的分子方差分析(AMOVA)输入文件。
- Seal_lice_Concatenated_phylogenomic_data_matrix.phy(.phy格式):系统发育分析用的串联基因组数据矩阵。
- Seal_lice_Genepop_formatted_file.genepop(.genepop格式):GenePop软件兼容的种群遗传学数据文件。
- 压缩文件:
- Seal_lice_files_for_gene_tree_analyses.zip(.zip格式):包含用于基因树分析的相关文件。
适用场景
- 濒危物种保护研究:分析宿主特异性寄生虫的种群结构与濒危机制。
- 种群基因组学分析:探究寄生虫近交水平与宿主传播率的关联。
- 空间生态学研究:验证寄生虫空间结构与宿主地理分布的一致性。
- 进化生物学研究:解析宿主-寄生虫协同进化的遗传证据。