数据集概述
本数据集为ZymoBIOMICS提供的人工微生物群落数据,包含8种细菌和2种真菌菌株,涵盖易裂解革兰氏阴性菌、难裂解革兰氏阳性菌及难裂解酵母,提供16S/18S rRNA序列和基因组信息,用于微生物多样性研究。
文件详解
该数据集包含8个文件,具体说明如下:
- FASTA格式序列文件(共7个):
- 文件名示例:Mock_ZymoBIOMICS_Repet1_RUN01.fasta、Mock_ZymoBIOMICS_Repet2_RUN02.fasta等
- 文件格式:FASTA(.fasta)
- 内容:基于Illumina MiSeq技术生成的16S rRNA基因V3-V4区域序列,来自两个独立测序批次(RUN01含4个重复样本,RUN02含3个重复样本)
- PDF格式文档(共1个):
- 文件名称:_d6300_zymobiomics_microbial_community_standard.pdf
- 文件格式:PDF(.pdf)
- 内容:人工微生物群落的具体组成说明,包含菌株种类及相关背景信息
适用场景
- 微生物多样性分析:用于验证16S rRNA基因V3-V4区域测序及分析流程的准确性
- 生物信息学方法测试:评估序列拼接、物种注释等生物信息学工具的性能
- 微生物群落研究:作为标准参考数据集,支持微生物群落结构相关的方法学研究
- 实验室质控:用于微生物测序实验的质量控制和方法优化