数据集概述
本数据集包含Taroni等人研究中使用的标准化基因表达数据(PCL文件)及标注WGCNA共表达模块分配的LPCL文件,研究聚焦系统性硬化症、肺纤维化和肺动脉高压三种纤维化疾病的组织特异性细胞调节因子,数据整合自多个GEO数据库 accession,以压缩包形式提供。
文件详解
- 文件名称:Expression_Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含两类文件——标准化表达数据文件(PCL格式)、标注WGCNA共表达模块分配的文件(LPCL格式),具体字段需解压后查看原始文件结构
数据来源
论文“A novel multi-network approach reveals tissue-specific cellular modulators of fibrosis in systemic sclerosis, pulmonary fibrosis, and pulmonary arterial hypertension”(bioRxiv,doi:10.1101/038950)及Gene Expression Omnibus(GEO)数据库( accession号:GSE9285、GSE32413、GSE45485、GSE59785、GSE76806、GSE76807、GSE76808、GSE48149、GSE68698、GSE19617、GSE22356)
适用场景
- 纤维化疾病分子机制研究:分析系统性硬化症、肺纤维化和肺动脉高压的组织特异性基因表达模式及细胞调节因子
- WGCNA共表达网络分析:利用标注模块分配数据探究疾病相关基因模块的功能及调控关系
- 跨疾病基因表达比较:整合多疾病数据识别纤维化疾病的共同或特异性分子标志物
- 生物信息学算法验证:为多网络分析方法在复杂疾病研究中的应用提供数据支持