数据集概述
本数据集整合卫星测量的海表温度、叶绿素a浓度数据,以及195种海洋双壳类692个种群的生长系数、体型、寿命数据库,并结合新的双壳类最大似然系统发育树,用于研究温度、初级生产力和进化史对双壳类生长率的影响,共包含9个文件。
文件详解
- 系统发育相关文件
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_alignment.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:双壳类序列比对文件,用于构建系统发育树
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_tree_file.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:双壳类系统发育树文件
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_order-level_constraint_tree.nwk
- 文件格式:NWK
- 字段映射介绍:双壳类目级约束树文件
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_partition_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:序列分区文件,包含16s、18s、28s、COI等基因片段的分区信息
- 数据文件
- 文件名称:Bivalve feeding ecology.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种名称、摄食生态类型及来源等字段
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_accession_numbers.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:双壳类序列 accession 编号数据表
- 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_SequenceMatrix_output.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:双壳类序列矩阵输出数据
- 文档与代码文件
- 文件名称:Saulsbury et al 2019 Supplementary Data.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:研究补充数据文档
- 文件名称:Saulsbury et al 2019 R code.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于数据分析的R代码文件
数据来源
论文“Evaluating the influences of temperature, primary production, and evolutionary history on bivalve growth rates”
适用场景
- 海洋生物学研究:分析温度、初级生产力对双壳类生长率的影响
- 进化生物学研究:探究进化史对双壳类生长率的约束作用
- 古环境重建:通过双壳类贝壳生长记录推断古代海洋环境
- 生态模型构建:为海洋生态系统中双壳类种群动态模型提供参数支持
- 系统发育分析:利用系统发育树研究双壳类的进化关系与生长率的关联