数据集概述
本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)在65摄氏度条件下进行的15N-1H ZZ交换弛豫实验数据。实验通过核磁共振技术测量蛋白质骨架氮氢键的化学交换动力学,每个.ft文件对应不同的时间延迟点,具体延迟时间由times.txt文件记录。化学位移赋值信息可在BMRB(生物磁共振数据库)中查询。数据集共包含25个文件。
文件详解
- 核磁共振谱图文件(NMR Spectra Files)
- 文件名称: 遵循
65zz[编号].ft模式(例如:65zz01.ft, 65zz06.ft)
- 文件格式: FT
- 字段映射介绍: 每个.ft文件为特定时间延迟点的核磁共振二维谱图数据,用于分析15N-1H相关信号随时间的衰减与恢复,进而计算化学交换速率。
- 实验参数文件(Experimental Parameters File)
- 文件名称:
times.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 包含两列数据,第一列为序号(number),第二列为对应的时间延迟(time (s)),时间范围从0秒到3秒,共24个时间点,与.ft谱图文件一一对应。
数据来源
生物磁共振数据库(BMRB)
适用场景
- 蛋白质动力学研究: 通过ZZ交换实验定量分析BMAL1 TAD结构域在特定温度下的构象交换过程和动力学参数。
- 核磁共振方法开发: 作为ZZ交换弛豫实验技术的标准数据集,用于方法验证与优化。
- 生物大分子结构稳定性分析: 研究温度对蛋白质结构稳定性和构象涨落的影响。
- 化学交换速率计算: 利用不同时间延迟点的谱图强度变化,拟合并计算化学交换速率常数。