数据集概述
本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)与肽基脯氨酰异构酶A(PPIA)相互作用的15N-1H ZZ交换核磁共振实验数据。数据由13个不同时间延迟的.ft谱图文件和1个时间参数说明文件组成,记录了蛋白质间化学交换的动力学过程。BMAL1 TAD的化学位移归属信息可在生物磁共振数据库(BMRB)查询。
文件详解
- 核磁共振谱图文件
- 文件名称: ppia01.ft, ppia02.ft, ..., ppia13.ft
- 文件格式: FT
- 字段映射介绍: 每个.ft文件对应ZZ交换实验中一个特定的时间延迟点,包含15N-1H二维核磁共振谱图数据,用于分析BMAL1 TAD与PPIA结合过程中的化学交换速率。
- 实验参数文件
- 文件名称: ppiatimes.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 包含两列数据:number(序号)和time (ms)(时间,毫秒),具体记录了每个.ft文件对应的实验延迟时间(0ms至3000ms)。
适用场景
- 蛋白质-蛋白质相互作用动力学研究: 通过ZZ交换实验定量分析BMAL1 TAD与PPIA的结合和解离速率常数。
- 核磁共振方法开发与验证: 作为ZZ交换脉冲序列应用的实例数据,用于方法学研究和教学演示。
- 生物大分子动力学模拟: 为分子动力学模拟提供实验验证数据,用于校准和验证计算模型。
- 结构生物学与药物发现: 研究PPIA对BMAL1转录活性的调控机制,为相关疾病治疗靶点开发提供基础数据。