BMAL1_TAD_PPIE相互作用15N_1H_ZZ交换完整实验数据

数据集概述

本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)与PPIE蛋白相互作用的15N-1H ZZ交换核磁共振实验数据。通过不同时间延迟的ZZ交换实验,研究蛋白质间的动力学特性。数据集包含12个.ft格式的谱图文件,对应12个不同的时间延迟点,时间信息由单独的文本文件记录。化学位移赋值信息可在BMRB数据库中查询。

文件详解

  • ZZ交换谱图文件
  • 文件名称: ppie01.ft, ppie02.ft, ..., ppie12.ft(共12个文件)
  • 文件格式: FT
  • 字段映射介绍: 每个.ft文件代表一个特定时间延迟点的核磁共振谱图数据,用于分析15N-1H的磁化矢量交换过程。
  • 时间延迟信息文件
  • 文件名称: ppietimes.txt
  • 文件格式: TXT
  • 字段映射介绍: 包含两列数据:name(编号)和time(时间,单位毫秒),具体对应关系为:1-0ms, 2-50ms, 3-100ms, 4-250ms, 5-500ms, 6-750ms, 7-1000ms, 8-1250ms, 9-1500ms, 10-1750ms, 11-2000ms, 12-2500ms, 13-3000ms。
  • 辅助文件
  • 文件名称: ppie12.ft.textClipping
  • 文件格式: TEXTCLIPPING
  • 字段映射介绍: 辅助文本剪辑文件,内容与主要数据文件相关。

数据来源

BMRB(生物磁共振数据库)

适用场景

  • 蛋白质相互作用动力学研究: 通过分析不同时间延迟点的ZZ交换谱图,研究BMAL1 TAD与PPIE之间的结合动力学和构象变化。
  • 核磁共振方法开发: 作为ZZ交换实验技术的实际应用案例,用于方法验证和优化。
  • 生物分子交换速率测定: 利用时间序列数据计算蛋白质间的化学交换速率常数。
  • 结构生物学研究: 结合BMRB中的化学位移信息,分析蛋白质相互作用的结构基础。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.03 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。