数据集概述
本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)与PPIL3蛋白相互作用的15N-1H ZZ交换核磁共振实验数据。通过不同延迟时间的ZZ交换实验,研究蛋白质间的动力学特性和相互作用过程。数据集包含13个不同延迟时间的核磁共振谱图文件以及对应的实验时间参数文件,化学位移参考数据可在BMRB数据库获取。
文件详解
- 核磁共振谱图文件(NMR Spectra)
- 文件名称:ppilthree01.ft至ppilthree13.ft(共13个文件)
- 文件格式:FT
- 字段映射介绍:每个.ft文件对应特定延迟时间的15N-1H ZZ交换核磁共振谱图数据,用于分析蛋白质动力学参数
- 实验参数文件(Experimental Parameters)
- 文件名称:ppilthreetimes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含两列数据:
- name:实验编号(1-13)
- time (ms):对应的延迟时间(单位:毫秒),时间序列为0-3000ms
数据来源
BMRB(生物磁共振数据库)
适用场景
- 蛋白质相互作用动力学研究:通过ZZ交换实验分析BMAL1 TAD与PPIL3的结合动力学参数
- 核磁共振方法开发:为核磁共振交换谱实验方法提供标准数据集
- 结构生物学研究:结合化学位移数据研究蛋白质复合物的结构特征
- 生物物理特性分析:研究蛋白质间的结合速率、解离常数等动力学参数