数据集概述
本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)的15N-1H ZZ交换核磁共振实验数据,用于研究蛋白质的动力学特性。数据由不同时间延迟的ZZ交换谱测量结果组成,包含13个傅里叶变换谱文件(.ft格式)和1个时间参数文件。化学位移赋值信息可在BMRB(生物磁共振数据库)中查询,数据集总计14个文件。
文件详解
- ZZ交换谱数据文件
- 文件名称: ppwd01.ft, ppwd02.ft, ppwd03.ft, ppwd05.ft, ppwd07.ft, ppwd10.ft, ppwd11.ft, ppwd12.ft等(共13个文件)
- 文件格式: FT
- 字段映射介绍: 每个.ft文件对应ZZ交换实验中一个特定时间延迟点的核磁共振谱数据,用于分析BMAL1 TAD结构域的构象交换动力学。
- 时间参数文件
- 文件名称: ppwdtimes.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 包含两列数据:name(序号)和time (ms)(时间,单位毫秒),记录了每个.ft谱图文件对应的实验时间延迟参数,时间点从0毫秒到3000毫秒共13个梯度。
适用场景
- 蛋白质动力学研究: 分析BMAL1转录激活结构域的构象交换速率和能量景观。
- 核磁共振方法开发: 用于验证和优化ZZ交换谱实验方法及数据处理流程。
- 结构生物学研究: 结合BMRB中的化学位移信息,深入理解蛋白质结构与功能关系。
- 生物物理计算: 为蛋白质动力学模拟和理论计算提供实验验证数据。