数据集概述
本数据集源自BMC Genomics 2015年发表的研究,聚焦野生二粒小麦(Triticum turgidum ssp. dicoccoides)自然种群的DNA甲基化表观遗传变异结构与程度。研究通过MSAP和TMD技术检测5个地理隔离种群50份材料的甲基化状态,经两代共同园种植确保可遗传变异分析,揭示种群特异性甲基化模式,为表观遗传多样性的生态地理结构研究提供数据支持。
文件详解
- README_for_Primer6 workspace files.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含研究背景、实验方法说明,以及MSAP和TMD凝胶提取的存在(1)/缺失(0)矩阵的结构说明,第一行为材料名称(Amiad、Tabgha等种群代号),第一列为序号。
- Primer6 workspace files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含Primer6工作区文件,具体内容需解压后查看,推测为支撑MSAP和TMD技术分析的原始数据或处理文件。
数据来源
BMC Genomics论文“Structure and extent of DNA methylation-based epigenetic variation in wild emmer wheat (T. turgidum ssp. dicoccoides) populations”
适用场景
- 小麦表观遗传学研究:分析野生二粒小麦种群间DNA甲基化表观遗传变异的结构与程度。
- 植物适应性进化研究:探究表观遗传多样性的生态地理结构及其对局部适应的影响。
- 分子标记技术应用:验证MSAP和TMD技术在检测植物基因组甲基化状态中的有效性。
- 作物遗传改良:挖掘野生二粒小麦可遗传的表观遗传变异资源,为小麦品种改良提供参考。