BMock12_Community_Standards_LMAS测试数据集

数据集概述

本数据集以BMock12群落标准的12个细菌复制子为参考,包含12种菌株的物种名称、样本ID及覆盖深度信息。原始测序数据源自SRR8073716,经降采样处理保留原样本20%的读数,主要挑战为组装ANIb相似度较高的菌株基因组。数据集包含2个文件。

文件详解

  • 文件名称:README.md
  • 文件格式:MD
  • 字段映射介绍:包含BMock12群落标准参考信息,列出12种菌株的物种名称(Species)、样本ID(Sample ID)、覆盖深度(Depth of Coverage (x))字段及对应数据。
  • 文件名称:report.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩格式文件,推测包含数据集相关的报告内容,具体字段需解压后查看。

适用场景

  • 微生物组基因组组装评估: 用于测试ANIb相似度较高菌株(如Micromonospora spp.、Halomonas spp.)的基因组组装算法性能。
  • 测序数据降采样效果分析: 研究保留20%读数对微生物组分析结果的影响。
  • 微生物群落结构分析: 基于12种菌株的覆盖深度数据,分析模拟群落的物种分布特征。
  • 生物信息学工具测试: 作为基准数据集,验证微生物组分析工具的准确性与效率。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 29.99 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。