数据集概述
本数据集是论文《Pathogen lifestyle determines host genetic signature of quantitative disease resistance loci in oilseed rape (Brassica napus)》的补充数据，包含油菜对四种真菌病原菌（Alternaria brassicicola、Botrytis cinerea、Pyrenopeziza brassicae、Verticillium longisporum）的数量抗病性（QDR）及PAMP诱导ROS响应的关联转录组分析数据，涉及表型数据、SNP标记、基因表达标记（GEMs）等核心内容，为油菜广谱抗病性研究提供支撑。
文件详解
- 文件名称：FINAL_Full_dataset_for_input_into_AT_analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含8个补充表格（Table S1-S8），各表格内容如下：
- Table S1：病原菌抗性及PAMP诱导ROS响应的标准化表型均值数据
- Table S2：病原菌抗性及ROS响应的全基因组关联分析（GWA）SNP标记及显著性数据，含曼哈顿图和QQ图
- Table S3：病原菌抗性及ROS响应的基因表达标记（GEMs）分析数据，含曼哈顿图
- Table S4：几丁质诱导ROS相关GEMs与其他性状共享GEMs的对比数据，含拟南芥同源基因注释
- Table S5：不同性状GEMs列表的富集分析结果，含表示因子计算
- Table S6：加权共表达基因网络分析（WGCNA）结果，含显著模块及GO注释
- Table S7：不同病原菌抗性共享GEMs数据，含拟南芥同源基因注释
- Table S8：Verticillium longisporum抗性关联标记连锁不平衡区域的基因列表及同源性分析
数据来源
论文“Pathogen lifestyle determines host genetic signature of quantitative disease resistance loci in oilseed rape (Brassica napus)”
适用场景
- 油菜广谱抗病性遗传机制研究：分析病原菌生活方式对宿主抗病基因位点的影响，挖掘广谱抗病候选基因
- 作物分子育种应用：利用SNP标记和GEMs数据开发油菜抗病分子标记，辅助抗病品种选育
- 植物免疫响应机制分析：通过PAMP诱导ROS响应数据研究油菜先天免疫信号通路
- 病原菌-宿主互作研究：对比不同生活方式病原菌的宿主抗性遗传特征差异
- 基因共表达网络分析：基于WGCNA结果解析油菜抗病相关基因模块及功能注释
