数据集概述
本数据集为论文“Evolutionary histories of breast cancer and related clones”的支持文件,包含用于分析乳腺癌及相关克隆进化历史的自定义R脚本与输入文件,涉及克隆结构评估、突变率估计、系统发育分析的突变矩阵生成、染色体增益与最近共同祖先时间估计等核心分析流程。
文件详解
- 文件名称:breast_evolution_analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 包含内容:
- 用于高斯混合模型评估单细胞类器官克隆结构的R脚本与TXT输入文件
- 用于线性回归模型估计正常类器官突变率的R脚本与TXT输入文件
- 用于生成MEGA和treemut系统发育分析突变矩阵的R脚本与TXT输入文件
- 用于估计1q增益、1q增益加倍及最近共同祖先出现时间的R脚本与TXT输入文件
数据来源
论文“Evolutionary histories of breast cancer and related clones”
适用场景
- 乳腺癌克隆结构分析: 利用高斯混合模型评估单细胞衍生类器官的克隆组成与异质性
- 肿瘤突变率研究: 通过线性回归模型估计正常乳腺类器官的突变积累速率
- 肿瘤进化系统发育分析: 生成突变矩阵用于构建乳腺癌克隆的进化树
- 染色体异常时间估计: 分析乳腺癌发生发展中1q染色体增益事件的时序与克隆演化关系