数据集概述
本数据集为论文“Genome-Scale Phylogenetics: Inferring the Plant Tree of Life from 18,896 Discordant Gene Trees”的补充数据，包含18,896个基因树的处理结果，涉及136个植物类群的510,922条蛋白质序列，用于通过基因树简约法分析植物系统发育关系，解决基因树不一致问题，支持植物生命树的构建与争议节点解析。
文件详解
- README_for_UnigeneAlignments.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：补充数据说明文档，包含数据集背景、文件内容说明（如UnigeneAlignments文件夹的18,896个掩码氨基酸比对文件）、文件命名规则（Phytome集群编号）、序列格式（phylip格式）及序列标识说明。
- UnigeneAlignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩归档文件，包含18,896个掩码氨基酸比对文件，每个文件对应一个基因树的比对数据，用于植物基因组系统发育分析。
数据来源
论文“Genome-Scale Phylogenetics: Inferring the Plant Tree of Life from 18,896 Discordant Gene Trees”
适用场景
- 植物系统发育研究: 利用基因树简约法分析136个植物类群的基因组数据，构建植物生命树并解析争议节点。
- 基因树不一致性分析: 研究植物基因复制与丢失导致的基因树与物种树差异，优化系统发育推断方法。
- 植物分类学验证: 验证木兰类与真双子叶+单子叶分支的亲缘关系，评估 eurosid I 和 II 分支的支持度。
- 基因组数据算法测试: 测试基因树简约法新软件在大规模数据集（18,896个基因树）上的运行性能与准确性。
- 植物进化生物学研究: 从核基因组视角探究植物大类群的系统发育关系，支持进化机制分析。
