数据集概述
本数据集为太平洋南莱恩群岛偏远珊瑚礁发现的绿藻门刚毛藻目新属种Brilliantia kiribatiensis的研究关联数据,包含系统发育分析用的核酸序列文件、序列来源表格、藻类覆盖度调查表格及形态测量数据,支撑该新属种的分类学与生态学研究。
文件详解
- 核酸序列文件(.fasta格式,共7个)
- 基础序列文件:SSU.fasta、LSU.fasta、ITS.fasta,分别为SSU rDNA、LSU rDNA和rDNA ITS序列
- 处理后序列文件:SSU_bmge.fasta、LSU_bmge.fasta、ITS_bmge.fasta,为经BMGE软件去除高变位点后的对齐序列
- concatenated_SSU_ITS_LSU.fasta:SSU、ITS、LSU序列的拼接对齐文件,分区为SSU(1-1797)、ITS1+5.8S+ITS2(1798-3335)、LSU(3336-3926)
- 说明文件(.txt格式,1个)
- 文件名称:concatenated_SSU_ITS_LSU_info.txt
- 内容:记录拼接序列的分区位置信息
- 表格文件(.xls/.xlsx格式,共3个)
- Table_S1_sequence_sources.xls:包含拼接系统发育数据集中序列的GenBank登录号、样本分离代码及采集地点
- Table_S2_percent_algal_cover.xlsx:1平方米照片样方中不同藻类群的覆盖度百分比,藻类群按属级(肉质大型藻类)或功能群( turf藻类、分枝红藻、壳状珊瑚藻、蓝细菌)分类
- Table_SX_morphometrics.xlsx:Brilliantia kiribatiensis的形态测量数据
数据来源
研究论文"Brilliantia kiribatiensis, a new genus and species of Cladophorales (Chlorophyta) from the remote coral reefs of the Southern Line Islands, Pacific Ocean"
适用场景
- 绿藻分类学研究:用于Brilliantia kiribatiensis新属种的系统发育分析与分类地位验证
- 珊瑚礁藻类群落生态学研究:通过藻类覆盖度数据,分析偏远珊瑚礁生态系统的藻类组成特征
- 海洋生物多样性调查:支撑太平洋南莱恩群岛珊瑚礁区域的绿藻多样性评估
- 藻类形态学研究:利用形态测量数据,开展刚毛藻目物种的形态特征比较分析