数据集概述
本数据集围绕密西西比黏滑蝾螈的景观遗传学研究展开,通过嵌套数据集比较分析,评估采样密度与研究区域大小对基因流相关栖息地特征推断的影响。包含遗传数据、元数据、分析代码及土地利用栅格文件,支持景观遗传学分析与方法验证。
文件详解
- 文件名称:Burgess_and_Garrick_2020_Metadata.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录样本元数据,包含样本ID、纬度(十进制,WGS 84 UTM 16N)、经度等地理信息,关联Holly Springs国家森林公园的采样数据。
- 文件名称:Burgess_and_Garrick_R_code2.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:景观遗传学分析所用的R代码文档,用于复现最大似然种群效应模型等分析过程。
- 文件名称:Burgess_and_Garrick_2020_Genotypes2020.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本ID、地理坐标(纬度、经度)及多态微卫星位点(如POG1、POG2、43M1等)的基因型数据,记录每个位点的等位基因数值。
- 文件名称:LandUseRasters.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为土地利用栅格数据,用于景观遗传学分析中的栖息地特征评估。
数据来源
论文“The effect of sampling density and study area size on landscape genetic inferences for the Mississippi slimy salamander (Plethodon mississippi)”
适用场景
- 景观遗传学方法验证:评估采样密度与研究区域大小对基因流推断结果的影响,优化研究设计。
- 蝾螈种群基因流分析:利用基因型数据结合土地利用栅格,探究栖息地特征对密西西比黏滑蝾螈基因流的阻碍或促进作用。
- 遗传多样性研究:基于微卫星位点数据,分析蝾螈种群的遗传结构与多样性水平。
- 生物保护策略制定:为密西西比黏滑蝾螈的栖息地保护与种群管理提供遗传学依据。