Burgess_and_Garrick_Based_密西西比黏滑蝾螈景观遗传学研究数据集

数据集概述

本数据集围绕密西西比黏滑蝾螈的景观遗传学研究展开,通过嵌套数据集比较分析,评估采样密度与研究区域大小对基因流相关栖息地特征推断的影响。包含遗传数据、元数据、分析代码及土地利用栅格文件,支持景观遗传学分析与方法验证。

文件详解

  • 文件名称:Burgess_and_Garrick_2020_Metadata.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录样本元数据,包含样本ID、纬度(十进制,WGS 84 UTM 16N)、经度等地理信息,关联Holly Springs国家森林公园的采样数据。
  • 文件名称:Burgess_and_Garrick_R_code2.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:景观遗传学分析所用的R代码文档,用于复现最大似然种群效应模型等分析过程。
  • 文件名称:Burgess_and_Garrick_2020_Genotypes2020.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含样本ID、地理坐标(纬度、经度)及多态微卫星位点(如POG1、POG2、43M1等)的基因型数据,记录每个位点的等位基因数值。
  • 文件名称:LandUseRasters.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内为土地利用栅格数据,用于景观遗传学分析中的栖息地特征评估。

数据来源

论文“The effect of sampling density and study area size on landscape genetic inferences for the Mississippi slimy salamander (Plethodon mississippi)”

适用场景

  • 景观遗传学方法验证:评估采样密度与研究区域大小对基因流推断结果的影响,优化研究设计。
  • 蝾螈种群基因流分析:利用基因型数据结合土地利用栅格,探究栖息地特征对密西西比黏滑蝾螈基因流的阻碍或促进作用。
  • 遗传多样性研究:基于微卫星位点数据,分析蝾螈种群的遗传结构与多样性水平。
  • 生物保护策略制定:为密西西比黏滑蝾螈的栖息地保护与种群管理提供遗传学依据。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 120.29 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。