数据集概述
本数据集围绕哺乳动物多形态钟与全证据端点定年研究,包含形态特征演化时钟分析、系统发育拓扑推断及分歧时间估计相关数据,涉及单时钟与多时钟模型对比及参数收敛、树结构等结果文件。
文件详解
该数据集包含26个文件,具体说明如下:
- 文档类文件:
- Description.docx: Word文档,可能为研究项目的详细描述
- C12_NodeAges.docx: Word文档,可能记录节点年龄相关数据
- B7_ClockstarResults.pdf: PDF文档,Clockstar分析结果
- B10_Randomised_clockstar_Results.pdf: PDF文档,随机化Clockstar结果
- C10_8clocks_topolConvergence.pdf: PDF文档,8时钟拓扑收敛性分析
- C5_1clock_topologyConvergence.pdf: PDF文档,单时钟拓扑收敛性分析
- 文本类文件:
- C6_1clock_paramConvergence.txt: 文本文件,单时钟参数收敛性摘要
- B11_ClockstaR_script.txt: 文本文件,ClockstaR分析脚本
- C11_8clocks_param_summary.txt: 文本文件,8时钟参数摘要
- 压缩包文件:
- C3_1clock_PostburninTrees&Params_folder.zip: 压缩包,单时钟后burnin树及参数文件夹
- C8_8clocks_PostburninTrees&Params_folder.zip: 压缩包,8时钟后burnin树及参数文件夹
- C1_PartitionFinder.zip: 压缩包,PartitionFinder相关文件
- 树结构文件:
- C4_1clock_con_fig.tre: 树文件,单时钟配置树
- C9_8clocks_con_fig.tree: 树文件,8时钟配置树
- C4_1clock_con_fig.tree: 树文件,单时钟配置树
- B3_TreeRef6_Parts1-28branchlengths_newick.trees: 树文件,参考树分支长度(Newick格式)
- B9_Randomised_TreeRef6_Parts1-28branchlengths_newick.trees: 树文件,随机化参考树分支长度
- B6_TreeRef9_Parts1-28branchlengths_newick.trees: 树文件,参考树分支长度
- MrBayes文件:
- B1_TreeRef6_MrBayesFile_Morph1-25.mrb: MrBayes文件,形态特征1-25参考树
- C7_8clocks.mrb: MrBayes文件,8时钟模型文件
- B8_Randomised_TOLMorph25p_TOL_Gam.mrb: MrBayes文件,随机化形态特征模型
- B4_TreeRef9_MrBayesFile_Morph1-25.mrb: MrBayes文件,参考树9形态特征文件
- 表格类文件:
- A1_CharacterPartitions.xlsx: Excel文件,特征分区数据
适用场景
- 分子系统学研究: 对比单时钟与多时钟模型对系统发育拓扑结构的影响
- 分歧时间估计: 分析多时钟方法对哺乳动物类群分歧时间的影响
- 形态特征演化研究: 探究形态特征分区及多时钟模型的可行性
- 系统发育方法学研究: 评估全证据定年方法中多时钟模型的应用价值
- 哺乳动物演化研究: 验证冠群胎盘类系统发育关系的合理性