数据集概述
本数据集为Okuyama等人关于“哺乳动物Sry基因分子进化功能衰退模型”研究的支持数据，包含进化分析、EMSA实验、Western blot实验的原始数据与分析文件，共21个文件，支持论文核心发现。
文件详解
- 进化分析文件：
- 序列文件：dNdS_Sox3_vs_Sry_input_seq.fas（FAS格式，Sox3与Sry基因序列）、mammals_10species_aa-seq_muscled.fas（FAS格式，10种哺乳动物氨基酸序列）等4个FAS文件
- 系统发育树文件：mammals_10species_phylogenic_tree_nuc_250307.nwk（NWK格式，核苷酸系统发育树）等2个NWK文件、dNdS_Sox3_vs_Sry_input_phylogenic_tree.tree（TREE格式，进化树输入文件）等2个TREE文件
- 分析结果文件：dNdS_Sox3_vs_Sry.txt（TXT格式，dN/dS分析结果）、mammals_10species_ancestral-seq_result.xlsx（XLSX格式，祖先序列重建结果）
- 控制文件：dNdS_Sox3_vs_Sry_ctl_file.ctl（CTL格式，分析控制文件）等2个CTL文件
- 实验数据文件：
- 凝胶定量文件：Quantification_of_band_density_with_imageJ.xlsx（XLSX格式，ImageJ条带密度定量结果）
- 压缩包文件：Eu-Afro.zip、WB_raw.zip等6个ZIP格式压缩包，包含EMSA、Western blot原始实验数据
- 说明文件：
- README.txt（TXT格式，文件说明与实验注释）
适用场景
- 分子进化研究：分析Sry基因与Sox3基因的dN/dS比值及进化约束差异
- 基因功能研究：探究哺乳动物Sry基因功能衰退的分子机制
- 实验验证分析：复现EMSA条带定量与Western blot实验结果
- 系统发育分析：基于10种哺乳动物序列构建基因进化树
