数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)BA1093 snf-10(hc194)V品系的行为实验记录,包含实验元数据及行为特征数据文件。实验于2009年11月18日开展,记录线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为,使用tierpsy软件追踪分析,可用于研究snf-10基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:snf-10 (hc194)V on food R_2009_11_18__11_13_4773_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的19201个分段骨骼特征,涉及运动轨迹、身体姿态等行为参数
- 实验数据文件:snf-10 (hc194)V on food R_2009_11_18__11_13_4773.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫行为记录,关联实验元数据(如帧率25.5102帧/秒、像素分辨率4.33311微米/像素等)
- 行为数据压缩文件:snf-10 (hc194)V on food R_2009_11_18__11_13_4773.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储WCON格式的线虫行为数据,包含标准化的行为时间序列记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析snf-10基因对线虫运动行为、摄食行为等表型的调控作用
- 线虫行为学分析:基于骨骼特征和轨迹数据,研究线虫在特定培养基上的行为模式
- 行为追踪算法验证:使用标准化行为数据验证线虫行为追踪软件的准确性
- 神经生物学研究:结合基因背景,探究snf-10基因参与的神经调控通路对线虫行为的影响