数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB270 unc-42(e270)V品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包含视频追踪数据及处理后的行为特征文件,可用于分析该基因突变体的行为模式。
文件详解
- 文件名称:
unc-42 (e270)I on food L_2010_08_03__11_36___3___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始或基础追踪数据,具体字段未明确说明,推测为视频帧对应的线虫位置、姿态等原始追踪信息
- 文件名称:
unc-42 (e270)I on food L_2010_08_03__11_36___3___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,推测涵盖运动轨迹、身体弯曲度、速度等行为学指标
- 文件名称:
unc-42 (e270)I on food L_2010_08_03__11_36___3___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据文件,wcon格式通常用于存储标准化的线虫行为追踪结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为分析: 研究unc-42(e270)V基因突变对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为等的影响
- 线虫行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程(Yemini等方法)的行为数据,可用于验证线虫行为实验的重复性与可靠性
- 行为特征提取算法评估: 利用原始追踪数据与特征文件,评估tierpsy软件提取线虫行为特征的准确性
- 神经发育与行为关联研究: 结合unc-42基因功能,分析基因突变与线虫行为表型的关联机制