数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了DA1814菌株(ser-1(ok345)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年12月17日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含原始追踪、特征提取及标准化格式的三类文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
ser-1 (ok345) on food R_2009_12_17__11_29_01__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,可能涵盖视频帧对应的线虫位置、姿态等基础观测信息
- 文件名称:
ser-1 (ok345) on food R_2009_12_17__11_29_01__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动轨迹、速度、弯曲度等量化指标
- 文件名称:
ser-1 (ok345) on food R_2009_12_17__11_29_01__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化的线虫行为数据交换格式文件,封装了行为时序数据及元信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究: 分析ser-1基因对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为等的影响
- 基因功能验证: 探究ok345等位基因突变体的表型特征,验证ser-1基因在行为调控中的作用
- 行为实验方法学参考: 基于Yemini等的实验方法,为同类线虫行为实验提供标准化流程参考
- 生物图像分析算法测试: 利用标注的行为特征数据,验证或优化线虫行为追踪算法的准确性
- 神经科学数据整合: 作为线虫行为数据库的一部分,支持多实验数据的联合分析与元研究