数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了EW35品系(携带sem-4(ga82)I基因变异)成年雌雄同体线虫在特定条件下的行为实验数据。实验由Laura Grundy在英国MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪数据及特征提取结果,可用于研究该基因变异对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food R_2010_07_22__16_25314.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始追踪数据,具体字段需解压后查看
- 核心行为数据文件
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food R_2010_07_22__16_25314.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的结构化数据,包含21516个分割骨架数据,涉及时间、位置等行为参数
- 行为特征数据文件
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food R_2010_07_22__16_25314_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度等特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析sem-4基因变异对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 线虫行为学分析:研究成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的运动、觅食等行为特征
- 实验方法验证:基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估:以tierpsy软件提取的特征数据为基础,评估行为特征提取算法的性能