数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了KU25品系pmk-1(km25)IV基因突变体成虫的行为实验数据。实验于2010年4月23日在英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为,包含视频分析后的特征数据与骨架数据,共3个文件。
文件详解
- pmk-1 (km25) on food R_2010_04_23__11_57_5547.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,可能包含线虫行为数据的标准格式文件(WCON格式),记录线虫运动轨迹等原始行为数据
- pmk-1 (km25) on food R_2010_04_23__11_57_5547_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征(如速度、弯曲度等)
- pmk-1 (km25) on food R_2010_04_23__11_57_5547.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的核心数据,包含18460个分段骨架数据,以及视频分辨率(4.7068微米/像素)、帧率(25.5754帧/秒)等元信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析pmk-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经行为学分析:探究线虫在食物环境中的行为模式与神经调控机制
- 行为追踪算法验证:以本数据集为基准,测试或优化线虫行为追踪软件的准确性
- 模式生物表型分析:为秀丽隐杆线虫基因突变体的表型鉴定提供行为学数据支持