数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2品系的行为实验数据,由英国Schafer实验室于2010年7月8日采集。数据记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为特征,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于线虫行为学研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:N2 on food R_2010_07_08__10_26_0381.hdf5、N2 on food R_2010_07_08__10_26_0381_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据(如骨架分割信息,共18178个分割骨架)、行为特征提取结果(基于tierpsy软件分析),涉及时间(总时长897.91秒)、帧率(25.7732帧/秒)、像素分辨率(4.52963微米/像素)等基础参数
- 标准化格式文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:N2 on food R_2010_07_08__10_26_0381.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台行为学数据整合与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为表型分析: 研究N2品系秀丽隐杆线虫在食物环境中的运动模式、行为节律等表型特征
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪技术的重复性与可靠性
- 神经生物学研究: 关联线虫行为数据与神经机制,分析基因或环境因素对行为的调控作用
- 行为数据分析工具测试: 用于tierpsy等行为追踪软件的性能评估与算法优化
- 模式生物数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支撑