数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL334品系(gpa-2(pk16)V基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动特征、骨架数据等,用于研究gpa-2基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food R_2010_02_26__10_23_2166_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,可能涉及运动轨迹、速度、弯曲度等由tierpsy软件提取的特征参数
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food R_2010_02_26__10_23_2166.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,可能包含时间序列的运动坐标、骨架信息等标准化行为记录
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food R_2010_02_26__10_23_2166.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始或处理后的核心数据,可能涉及视频帧对应的线虫位置、骨架分割数据等基础追踪信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-2(pk16)V突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验: 探究线虫行为与基因表达的关联机制
- 行为学数据分析方法验证: 基于tierpsy软件输出的特征数据,优化线虫行为特征提取算法
- 模式生物实验标准化研究: 参考实验协议(E. Yemini等方法),建立统一的线虫行为实验流程
- 基因-行为关联分析: 结合线虫基因型与运动特征数据,挖掘gpa-2基因在行为调控中的作用机制