数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2030品系(携带nlp-3(ok2688)X等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在特定培养条件下进行,包含视频追踪数据及行为特征提取结果,可用于研究nlp-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2009_06_05__11_33__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式压缩文件,记录线虫运动的时间序列数据。
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2009_06_05__11_33__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包括运动参数、身体姿态等特征指标。
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2009_06_05__11_33__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的基础数据,如视频帧信息、线虫骨架分割数据(共5810个分割骨架)、时间戳等元数据。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-3基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用。
- 分子生物学实验验证: 验证E. Yemini等人实验方法在特定线虫品系行为研究中的适用性。
- 线虫行为特征提取: 利用tierpsy软件提取的特征数据,研究线虫行为模式与基因的关联。
- 实验条件优化: 分析培养条件(如NGM低蛋白胨培养基、OP50食物)对秀丽隐杆线虫行为的影响。