数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB559品系(srp-8基因ok291突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年9月开展,包含线虫在NGM培养基上的运动行为特征,由MRC分子生物学实验室采用Tierpsy软件采集分析,可用于线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_13__15_59410_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于Tierpsy软件分析结果生成
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_13__15_59410.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,格式为wcon
- 核心数据文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_13__15_59410.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,涉及26647个分割骨架数据,记录线虫运动的时间、空间特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析srp-8基因ok291突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 分子生物学实验验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为实验方法的重复性与可靠性
- 线虫行为特征分析: 基于骨架数据、运动参数研究成年线虫在食物环境中的行为模式
- 基因与行为关联分析: 探索特定基因突变体(如srp-8(ok291))与线虫运动行为的关联机制