数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB559品系(携带srp-8基因ok291突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为实验数据。实验由Laura Grundy在William R Schafer实验室完成,包含视频跟踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析突变体线虫的运动行为特征。
文件详解
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food R_2011_09_20__11_23_5181.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、时间戳等基础信息
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food R_2011_09_20__11_23_5181_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲度、身体姿态等量化指标
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food R_2011_09_20__11_23_5181.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON标准化格式压缩文件,用于跨平台数据共享与整合
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析srp-8基因ok291突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 生物行为学实验方法验证: 基于标准化实验方案(E. Yemini et al.方法)验证行为学实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估: 对比不同工具提取的线虫行为特征数据,优化跟踪算法性能
- 模式生物行为数据库构建: 作为标准化线虫行为数据纳入公共数据库,支持大规模数据分析与挖掘