数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB738 snf-4(ok496)II品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中的行为特征,包括视频跟踪数据、行为特征参数等,可用于研究snf-4基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:snf-4 (ok496)II on food L_2009_11_17__14_30_4444.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的结构化数据文件(WCON格式),记录线虫运动的时空坐标等基础行为信息
- 特征数据文件:
- 文件名称:snf-4 (ok496)II on food L_2009_11_17__14_30_4444_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征参数,涵盖运动、姿态等多维度行为指标
- 原始跟踪数据文件:
- 文件名称:snf-4 (ok496)II on food L_2009_11_17__14_30_4444.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频跟踪的原始数据,如22243个分割骨架数据、帧率(27.248帧/秒)、像素分辨率(4.69255微米/像素)等实验参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析snf-4基因敲除(ok496)对线虫行为表型的影响
- 行为生物学分析:研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等特征
- 生物信息学算法验证:用于测试或优化线虫行为特征提取算法(如tierpsy软件)
- 神经科学研究:探索神经相关基因对线虫行为调控的分子机制