数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB753 lov-1(ok522)II品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为特征,包括视频追踪数据、行为特征提取结果等,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:
lov-1 (con5221) on food L_2010_03_19__11_58_48___6___8.hdf5
- 内容说明:存储线虫行为的原始追踪数据,包含19210个分割骨架信息,对应898.867秒实验时长、每秒26.0417帧的视频数据
- 文件名称:
lov-1 (con5221) on food L_2010_03_19__11_58_48___6___8_features.hdf5
- 内容说明:存储经Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于视频像素与实际长度映射(4.33523微米/像素)生成
- 归档文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:
lov-1 (con5221) on food L_2010_03_19__11_58_48___6___8.wcon.zip
- 内容说明:WCON格式的行为数据压缩包,用于线虫行为数据的标准化存储与交换
数据来源
C.elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型研究:分析lov-1基因缺失对秀丽隐杆线虫运动、觅食等行为的影响
- 神经生物学机制探索:结合基因背景与行为数据,探究lov-1基因在神经调控中的作用
- 行为分析算法验证:利用标注的骨架数据与特征文件,测试或优化线虫行为追踪算法
- 模式生物实验标准化参考:为同类线虫行为实验提供实验设计(如30分钟适应期、视频参数)与数据存储的参考模板