C_elegans_Based_RB777_hcf_1_ok559_IV秀丽隐杆线虫行为实验数据_2011

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2011年9月6日开展的RB777菌株(携带hcf-1(ok559)IV基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过视频追踪获取线虫运动特征,包含原始追踪数据、标准化格式数据及特征提取结果,共3个文件。

文件详解

  • 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:推测为原始视频追踪数据文件,包含线虫运动轨迹的像素坐标、时间戳等基础追踪信息
  • 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
  • 字段映射介绍:标准化行为数据压缩包,wcon格式通常包含线虫运动的结构化时间序列数据(如位置、速度、弯曲度等)
  • 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:特征提取结果文件,包含基于追踪数据计算的线虫行为特征(如运动速度、身体弯曲频率、停留时间等)

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究: 分析hcf-1基因缺失对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为表型的影响
  • 神经行为学实验验证: 验证E. Yemini等提出的线虫行为实验方法在基因突变株中的适用性
  • 行为特征提取算法测试: 用于测试或优化tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取性能
  • 模式生物行为数据库补充: 作为公开线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 313.38 MiB
最后更新 2025年12月31日
创建于 2025年12月31日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。