数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2011年9月6日开展的RB777菌株(携带hcf-1(ok559)IV基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过视频追踪获取线虫运动特征,包含原始追踪数据、标准化格式数据及特征提取结果,共3个文件。
文件详解
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为原始视频追踪数据文件,包含线虫运动轨迹的像素坐标、时间戳等基础追踪信息
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化行为数据压缩包,wcon格式通常包含线虫运动的结构化时间序列数据(如位置、速度、弯曲度等)
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_06__16_12_33__8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:特征提取结果文件,包含基于追踪数据计算的线虫行为特征(如运动速度、身体弯曲频率、停留时间等)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析hcf-1基因缺失对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为表型的影响
- 神经行为学实验验证: 验证E. Yemini等提出的线虫行为实验方法在基因突变株中的适用性
- 行为特征提取算法测试: 用于测试或优化tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取性能
- 模式生物行为数据库补充: 作为公开线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析